Fakultas Pertanian merupakan salah satu Fakultas yang berada di Universitas Muhammadiyah Makassar, dibidang ilmu eksakta yang didirikan pada tahun 1994 dengan nomor SK Pendirian Fakultas Nomor 034/D/O/1994, dimana Fakultas ini didirikan untuk menjawab tantangan pengembangan potensi sumberdaya pertanian di Indonesia, dan hingga saat ini telah memiliki empat program studi unggulan di jenjang strata satu yang telah TERAKREDITASI Oleh Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN – PT) yaitu :

1. Budidaya Perairan Akreditasi B
2. Agribisnis Akreditasi B
3. Kehutanan Akreditasi B
4. Agroteknologi Proses Akreditasi

Sampai saat ini, Fakultas Pertanian telah mengalami empat kali pergantian pimpinan fakultas. Staf yang pernah memimpin Fakultas Pertanian sampai saat ini ialah :

Daftar Dekan Fakultas Pertanian Universitas Muhammadiyah Makassar
No	Foto	Nama	Periode
1		Ir. Nasaruddin Lo	2000 – 2004
2		Ir. H. Muhammad Syaiful Saleh, M.Si	2004 – 2008
3		Ir. H. Saleh Molla, M.M	2008 – 2012 2013 – 2017
4		H. Burhanuddin, S.Pi., M.P.	2017 – 2021